崇真會曾於1965年成立主日學部，目的為推展兒童宗教教育，加強各堂主日學之聯合工作，首屆部長為曾榮輝牧師，副部長為周美珍姑娘。
區主日學部曾舉辦多項聯合活動如：教職員退修會、師生聯歡會、主日學教師訓練班、事工討論會等，在當中分享各堂主日學情況，學習不同的教學法、認識兒童心理發展。90年代初起，聯合性事工活動參與人數開始驟降，各堂主日學事工亦有各自的發展，直至2002年2月，總董會議決取消總會主日學部之設立。
以下是昔日主日學部舉行活動之相片。
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| 1969年4月12日舉辦「教職員退修會」(崇真 第30期) |
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| 1969年6月份 各堂主日學概況調查 (崇真 第30期) |
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| 1980年夏舉辦「主日學事工研討會」 |
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| 1981年8月舉辦給主日學導師之活動 |
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| 1982年10月舉辦「主日學部教師退修會」 |
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| 1985年12月26日舉辦「師生聯歡會」 |
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| 1989年3月25日舉辦「陸運精英逐個捉」 |
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